Abreviaturas y acrónimos en Bioquímica
La
Bioquímica es un campo con muchos actores: proteínas, secuencias de
DNA, ligandos etc. Por lo tanto existe una necesidad de nombrar una
enorme variedad de moléculas. En los primeros tiempos se
utilizaron nombres propios : por ejemplo actina o miosina.
No obstante, en la actualidad los nombres son principalmente
descriptores de la función de la molécula, en inglés, como
CRE-binding protein (CREB) o poly-A-tail binding
protein (PAB protein). Estos son nombres muy largos, no muy
convenientes para el uso coloquial diario. Por eso normalmente los
bioquímicos se refieren a ellos por sus acrónimos. Por otro lado, conocer el origen que suyace a un acrónimo es muy útil para memorizar el nombre y también, no menos importante, para conocer y entender el papel de la molécula, su función. Es por ello que una recopialción de varias abreviaturas y acrónimos en uso frecuente puede ser valiosa.
Diapositivas de clase
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Fundamentos químicos
Biomoléculas
Propiedades químicas de las biomoléculas, reacciones químicas e interacciones débiles entre biomoléculas.
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ODFAgua y equilibrios ácido-base
Estructura y propiedades del Agua, ácidos, bases, pH, pKa y tampones.
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Proteínas: estructura y función
Estructura y plegamiento de proteínas
Propiedades de los aminoácidos, enlace peptídico, plegamiento de proteínas. estructura secundaria. Estructuras de orden superior, motivos y dominios proteicos.
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Estructura-función: proteínas de membrana, fibrilares y globulares
Proteínas en solución. Características estructurales de proteínas de membrana y fibrilares. Proteínas globulares: hemoglobina.
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Estructura-función: enzimas
Cinética química y mecanismos de catálisis enzimática. Cinética enzimática y mechanismos de inhibición. Regulación de la actividad de enzimas.
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Estructura del DNA y Biología molecular
DNA, genes y cromosomas
Estructuras del DNA, estabilidad, desnaturalizacióm, hibridación y topología. Estructura de cromatina y cromosomas. Organización genómica.
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Replicación, reparación y recombinación de DNA
Aspectos generales de la replicación: fidelidad y procesividad. Maquinaria replicativa de eucariotas. Recombinación. Mecanismos moleculares de daño al DNA. Mecanismos de reparación.
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Transcripción y procesado del RNA
Conceptos generales de la transcripción en bacterias y eucariotas. Ensamblaje del complejo RNApolII. Procesado del transcrito eucariótico. Transporte nucleo-citoplasmático. Degradación del RNA.
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Síntesis y degradación de proteínas
Código genético y aminoacil-tRNA sintetasas. Ribosomas como máquinas moleculares. Modificaciones post-traduccionales de proteínas. Ubiquitina y mecanismos de degradación y recambio proteico.
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Regulación de la expresión génica
Operones bacterianos. Regulación de la compactación de la cromatina. Factores de transcripción eucarióticos, complejos mediadores y de remodelación. Estructura y función de receptores nucleares. Mecanismos post-transcripcionales de regulación de la expresión.
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Transporte a través de membrana y mecanismos de señalización
Transporte a través de membrana y su bioenergética
Química física de la difusión y el transporte. Bases iónicas del potencial de membrana. Canales iónicos y transportadores de membrana. Sistemas de transporte activo: bombas iónicas y co-transportadores.
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Mecanismos de señalización
Mecanismos de comunicación intercelular y receptores de membrana. Receptores GPCR y segundos mensajeros. Vías relacionadas con RTK: estrategias de señalización de EGFR e InsR.
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